Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VarsQ9Z1Q9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VarsQ9Z1Q9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms