Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx39bQ9Z1N5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx39bQ9Z1N5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms