Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d3Q9Z1L5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1171.1 ms