Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek4Q9Z1J2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nek4Q9Z1J2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nek4Q9Z1J2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek4Q9Z1J2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nek4Q9Z1J2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms