Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Shcbp1Q9Z179 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shcbp1Q9Z179 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Shcbp1Q9Z179 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms