Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stau1Q9Z108 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stau1Q9Z108 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stau1Q9Z108 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stau1Q9Z108 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stau1Q9Z108 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms