Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skp2Q9Z0Z3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skp2Q9Z0Z3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp2Q9Z0Z3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms