Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn3Q9Z0G9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms