Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PapolbQ9WVP6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PapolbQ9WVP6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PapolbQ9WVP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms