Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapaQ9WV55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VapaQ9WV55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms