Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn3Q9WUK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn3Q9WUK7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms