Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scnn1gQ9WU39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scnn1gQ9WU39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scnn1gQ9WU39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scnn1gQ9WU39 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms