Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn5Q9WU28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn5Q9WU28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn5Q9WU28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn5Q9WU28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms