Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsfQ9R013 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsfQ9R013 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsfQ9R013 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsfQ9R013 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms