Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copg1Q9QZE5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copg1Q9QZE5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms