Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11aQ9QYE3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bcl11aQ9QYE3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bcl11aQ9QYE3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms