Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sall2Q9QX96 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sall2Q9QX96 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Sall2Q9QX96 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sall2Q9QX96 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sall2Q9QX96 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms