Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh5Q9QUM7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msh5Q9QUM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh5Q9QUM7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh5Q9QUM7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms