Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO1C1Q9NYB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1C1Q9NYB5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1C1Q9NYB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms