Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaja4Q9JMC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaja4Q9JMC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaja4Q9JMC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaja4Q9JMC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnaja4Q9JMC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms