Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42ep4Q9JM96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep4Q9JM96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdc42ep4Q9JM96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms