Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SigirrQ9JLZ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SigirrQ9JLZ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SigirrQ9JLZ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SigirrQ9JLZ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SigirrQ9JLZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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