Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2l2Q9JLG4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms