Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ldb3Q9JKS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ldb3Q9JKS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb3Q9JKS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms