Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nova1Q9JKN6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nova1Q9JKN6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nova1Q9JKN6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nova1Q9JKN6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms