Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msgn1Q9JK54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msgn1Q9JK54 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msgn1Q9JK54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Msgn1Q9JK54 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Msgn1Q9JK54 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msgn1Q9JK54 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms