Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smpd3Q9JJY3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpd3Q9JJY3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd3Q9JJY3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms