Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfhx4Q9JJN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfhx4Q9JJN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfhx4Q9JJN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms