Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Caln1Q9JJG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Caln1Q9JJG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caln1Q9JJG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Caln1Q9JJG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caln1Q9JJG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms