Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF9

Sppl2a, Signal peptide peptidase-like 2A, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2aQ9JJF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2aQ9JJF9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl2aQ9JJF9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2aQ9JJF9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl2aQ9JJF9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl2aQ9JJF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sppl2aQ9JJF9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2aQ9JJF9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl2aQ9JJF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms