Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmbr1Q9JIT0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmbr1Q9JIT0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbr1Q9JIT0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms