Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl28Q9JIL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl28Q9JIL2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl28Q9JIL2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms