Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufa13Q9ERS2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufa13Q9ERS2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa13Q9ERS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms