Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1c1Q9ERB5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco1c1Q9ERB5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slco1c1Q9ERB5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1c1Q9ERB5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slco1c1Q9ERB5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms