Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps35Q9EQH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps35Q9EQH3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps35Q9EQH3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps35Q9EQH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms