Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr1Q9EPQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr1Q9EPQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr1Q9EPQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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