Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde1Q9DBZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syde1Q9DBZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde1Q9DBZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms