Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tysnd1Q9DBA6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tysnd1Q9DBA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tysnd1Q9DBA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms