Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scp2d1Q9DAH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scp2d1Q9DAH1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms