Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmco5aQ9D9D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco5aQ9D9D5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco5aQ9D9D5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.6 ms