Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam3aQ9D8T0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3aQ9D8T0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam3aQ9D8T0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam3aQ9D8T0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms