Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D8N1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q9D8N1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D8N1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D8N1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D8N1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D8N1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D8N1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms