Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chmp4bQ9D8B3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chmp4bQ9D8B3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp4bQ9D8B3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp4bQ9D8B3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms