Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn9Q9D805 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn9Q9D805 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn9Q9D805 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms