Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca1Q9D7Z6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca1Q9D7Z6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca1Q9D7Z6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms