Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capns2Q9D7J7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capns2Q9D7J7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capns2Q9D7J7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms