Protein–RNA interactions for Protein: Q9D799

Mtfmt, Methionyl-tRNA formyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtfmtQ9D799 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MtfmtQ9D799 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MtfmtQ9D799 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MtfmtQ9D799 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms