Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gcc1Q9D4H2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcc1Q9D4H2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcc1Q9D4H2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms