Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmntd1Q9D4C1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmntd1Q9D4C1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd1Q9D4C1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmntd1Q9D4C1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms