Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OxsmQ9D404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OxsmQ9D404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OxsmQ9D404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OxsmQ9D404 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms